从零开始的Rietveld精修 we we WSS=∑iwi(Iiexp−Iicalc)2,wi=1IiexpWSS=\sum_i w_i(I_i^{exp}-I_i^{calc})^2, w_i=\dfrac{1}{I_i^{exp}} WSS=i∑wi(Iiexp−Iicalc)2,wi=Iiexp1 Iicalc=SF∑kLk∣Fk∣2S(2θi−2θk)PkA+bkgiI_i^{calc}=S_F\sum_ 2025-06-06 从零开始的科研之旅 > first stage #化学 #科研
使用Multiwfn+VMD绘制分子的表面静电势图(ESP) Multiwfn版本:3.8(dev),Last update: 2025-May-5 VMD版本:1.9.3 VMD版本请尽可能使用1.9.3而不要使用bug较多的1.9.4 本文参考了Sob老师的博文 目标分子的结构优化 本次的目标分子为二茂铁分子 首先建立二茂铁分子的模型,并且手动设置全重叠的D5d点群,这样可以极大的减少优化用时,关键词如下: 1#p tpssh/def2tzvp 2025-05-30 从零开始的科研之旅 > first stage #化学 #科研
从零开始的电化学阻抗谱原理 什么是电化学阻抗谱? 有一种叫做黑箱的未知特性系统。可采用一系列测量方法,通过施加输入信号并检测输出响应来探查黑箱。例如,假设将黑箱置于暗室中,然后施加特定波长的光照。若观察到响应信号(如电流),则可判定箱内物质具有光活性。输入与输出之间的关系称为“传递函数”,阻抗谱是传递函数的一种特例。 阻抗:电路中电阻、电感、电容对交流电个阻碍作用个统称。阻抗是一个复数,实部称为电阻,虚部称为电抗。电化学过 2025-05-27 从零开始的科研之旅 > first stage #化学 #科研
科研中的小问题 实验部分 球磨 球磨的原理是什么? 球磨的作用是什么? 200rpm合不出来,300rpm就能合出来? X-ray diffraction X射线是什么? X射线衍射的原理和用途是什么? XRD谱图的横坐标和纵坐标分别是什么意义? XRD为什么会产生峰?峰是什么意义? 横坐标2theta角度为什么通常选择20∘^\circ∘~80∘^\circ∘ 单晶衍射和粉末衍射分别是什么? 关于消 2025-05-25 从零开始的科研之旅 > first stage #化学 #科研
从零开始的X射线原理 前言 1917 年,赫尔首次描述了简单粉末衍射仪的构造,这是在 1895 年威廉·康拉德·伦琴发现 X 射线后不久。衍射仪测量 X 射线反射的角度,从而获得其包含的结构信息。如今,这项技术的分辨率有了显著提高,它被广泛用作分析相信息和解决固态材料晶体结构的工具。X 射线衍射技术用于确定样品的组成或晶体结构。对于大分子和无机化合物等较大的晶体,它可用于确定样品中原子的结构。如果晶体尺寸太小,它可以 2025-05-24 从零开始的科研之旅 > first stage #化学 #科研
使用Multiwfn加载ELFCAR文件绘制等值面图 本文仅为学习记录,并非教程 Multiwfn是一个波函数分析程序,功能非常强大,也能绘制ELF等值面图,它支持多种类型的输入文件,既有量子化学计算程序的输出文件,又有第一性原理计算程序的输出文件 以下是Multiwfn加载ELFCAR绘制等值面图的过程 step1:用ELFCAR绘图其实是基于格点数据文件的绘图,需要修改根目录下的配置文件settings.ini,将参数iuserfunc改为- 2025-05-18 从零开始的科研之旅 > VASP #化学 #科研
掺杂质量计算的python脚本 起因是我想合成各式各样的材料,需要用到各种药品,计算起来比较麻烦,尤其是非化学计量比的化合物比如Li5.3PS4.3Cl0.7Br\mathrm{Li_{5.3}PS_{4.3}Cl_{0.7}Br}Li5.3PS4.3Cl0.7Br,遂用AI写了一个python脚本,个人觉得还是比较实用 123456789101112131415161718192021222324252627282930 2025-05-17 从零开始的科研之旅 > VASP #化学 #科研
费米孔 Coulomb孔 由于Coulomb孔的存在,电子之间存在动态相关,如何描述原子分子体系中电子之间的动态相关是量子化学的主要任务 玻色子的波函数是对称的,没有反对称性的要求因此可以靠得很近 Hartree-Fock方程与自洽场计算 HF方程 HF方程是量子化学中计算多电子体系近似波函数和能量的基本方法,通过“平均场”近似把复杂的多电子问题拆解成单电子问题。 多电子波函数用单电子轨道(分 2025-05-16
初学ELF电子定域化函数的计算与分析 本文仅为学习记录,并非教程 这次记录文主要侧重于应用,参考了Sob老师的博文和网络上的各大教程 以FCC Cu为例进行ELF计算与分析 采用FCC面心立方最密堆积的铜单胞,使用vasp计算,先进行结构优化,确认收敛后进行ELF计算 123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839Global Paramet 2025-05-14 从零开始的科研之旅 > VASP #化学 #科研
2025年5月Intel平台VASP.6.4.3的编译安装 2025年5月Intel平台VASP.6.4.3的编译安装 WSL的安装 选择Arch Linux,个人比较熟悉,仅供学习使用不作为稳定的生产力环境,配置如下,两颗E5 2676 v3 打开powershell或者终端,输入wsl --install archlinux以自动安装,这一步需要使用代理(MAGIC),主机上使用Clash-Verge进行代理(运气好也能连上),终端中输入: 1 2025-05-12 从零开始的科研之旅 > VASP #化学 #科研