IRI等值面图

启动Multiwfn,载入输入文件,我使用的输入文件是.fchk文件,别的如.wfn文件等也可以

使用功能20 Visual study of weak interaction,进行弱相互作用分析,选择4 IRI: Interaction region indicator analysis (Chemistry-Methods, 1, 231)进行IRI分析,选择精度,这里我选的是高精度3 High quality grid, covering whole system, about 1728000 points in total(精度是根据格点数目确定的,对于巨大体系可能高精度也不够用需要手动指定格点数目)

已完成IRI分析

至此,格点计算已经完成,然后我们导出数据3 Output cube files to func1.cub and func2.cub in current folder,借助VMD 分子可视化程序画出更好看的图,将载入文件所在文件夹下导出的func1.cubfunc2.cub(这两个文件分别记录的是sign(λ2)ρ和IRI格点数据)复制到VMD程序的根目录并在根目录下新建一个脚本文件,名为IRIfill.vmd,内容为:

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mol new func1.cub
mol addfile func2.cub
mol delrep 0 top
mol representation CPK 1.0 0.3 18.0 16.0
mol addrep top
mol representation Isosurface 1.0 1 0 0 1 1
mol color Volume 0
mol addrep top
mol scaleminmax top 1 -0.04 0.02
mol modstyle 0 top CPK 0.700000 0.300000 18.000000 16.000000
color scale midpoint 0.666
color scale method BGR
color Display Background white
axes location Off
display depthcue off
display rendermode GLSL
light 3 on
color Element N iceblue
mol modcolor 0 top Element

然后启动VMD,在文本窗口中输入source IRIfill.vmd