使用IRI方法进行弱相互作用分析
IRI等值面图
启动Multiwfn,载入输入文件,我使用的输入文件是.fchk
文件,别的如.wfn
文件等也可以
使用功能20 Visual study of weak interaction
,进行弱相互作用分析,选择4 IRI: Interaction region indicator analysis (Chemistry-Methods, 1, 231)
进行IRI分析,选择精度,这里我选的是高精度3 High quality grid, covering whole system, about 1728000 points in total
(精度是根据格点数目确定的,对于巨大体系可能高精度也不够用需要手动指定格点数目)

至此,格点计算已经完成,然后我们导出数据3 Output cube files to func1.cub and func2.cub in current folder
,借助VMD
分子可视化程序画出更好看的图,将载入文件所在文件夹下导出的func1.cub
和func2.cub
(这两个文件分别记录的是sign(λ2)ρ和IRI格点数据)复制到VMD程序的根目录并在根目录下新建一个脚本文件,名为IRIfill.vmd
,内容为:
1 | mol new func1.cub |
然后启动VMD,在文本窗口中输入source IRIfill.vmd
,